用放在原来的瓶子或容器中不加稀疏的保存。让这种酸的相对湿度保持在50%，温度范围在10-30摄氏度之间。温度超过40摄氏度会使颗粒状柠檬酸变硬。不要在这种酸中加水或其它液体，这会降低其效力。柠檬酸提高矿物质在鱼体内的沉积的机理可能是：柠檬酸降低肠中的pH，促进饲料中矿物质的溶解；柠檬酸能够结合肠中各种阳离子，充当螯合剂促进对矿物质的吸收阈。

柠檬酸发酵要求较强的通风条件，有利于在发酵液中维持一定的溶解氧量。通风和搅拌是增加培养基内溶解氧的主要方法。柠檬酸对常见水产病原菌：副溶血弧菌、嗜水气单胞菌、荧光假单胞菌具有持续压制作用。饲料经过柠檬酸酸化后喂食，可以减少鱼虾类被病原微生物侵袭机会，保护鱼虾健康。柠檬酸和改性柠檬酸可制成一种无甲醛防皱整理剂，用于纯棉织物的防皱整理。不仅防皱效果好，而且成本低。

柠檬酸可降低日粮的PH值，提高胃肠道的酸度和消化酶活性，促进乳酸菌繁殖，抑制生长。在42日龄猪的日粮中分别添加0.7％和1％的柠檬酸，可使其胃内容物的PH值从4.5分别降至4.2和3.5，柠檬酸还是一种常用食品添加剂。可以作为调味品添加到各种饮料中。它也是一种很好的嫩肉剂，因为柠檬酸有分解肉类蛋白的倾向。但它带有苦味，因此在食品方面的主要用途是增加糖果酸味。