苹果树施人充足的有机肥，减少氮肥的施用量可减轻套袋果含糖量降低，是提高苹果质量的关键。增施有机肥，一般盛果期苹果园，在每亩地施4000公斤左右优质腐熟的有机肥的基础上，及时抓好萌芽前、幼果期及果实迅速生长期的土壤追肥，尤其要注意含钾、钙、锌和硼等元素肥料的适时适量施用，防止养分损失和产生拮抗作用。

施肥标准应根据肥料的有效成分，折算施肥量，按每亩地产2500公斤以上的苹果园，有机肥的施用量，一般要达到“斤果斤肥”的标准，也即每生产100千克苹果需施氮肥1公斤，磷肥0.5公斤，钾肥1.2公斤。

基肥的施用量占全年施用量的60%-70% ，是套袋苹果树最重要的营养来源，基肥以有机肥为主，必须要经过充分腐熟。秋季气温稍高，施肥时切伤的根系容易恢复，易增加部分树体营养，翌年春根系能很好地吸收利用。一般中熟品种采收后即可施有机肥，晚熟品种如红富士等宜在秋末、封冻前施完。在秋施基肥的同时，多施人磷肥、钾肥和钙镁肥等，以确保套袋果内在品质的提高。